conkit
conkit.applications
conkit.applications.bbcontacts
conkit.applications.ccmpred
conkit.applications.cdhit
conkit.applications.hhblits
conkit.applications.hhfilter
conkit.applications.jackhmmer
conkit.applications.map_align
conkit.applications.psicov
conkit.command_line
conkit.command_line.conkit_convert
conkit.command_line.conkit_msatool
conkit.command_line.conkit_plot
conkit.command_line.conkit_precision
conkit.command_line.conkit_predict
conkit.command_line.conkit_validate
conkit.core
conkit.core.contact
conkit.core.contactfile
conkit.core.contactmap
conkit.core.distance
conkit.core.distancefile
conkit.core.distogram
conkit.core.entity
conkit.core.mappings
conkit.core.sequence
conkit.core.sequencefile
conkit.core.struct
conkit.io
conkit.io.a2m
conkit.io.a3m
conkit.io.aleigen
conkit.io.alphafold
conkit.io.bbcontacts
conkit.io.bclcontact
conkit.io.casp
conkit.io.caspmode2
conkit.io.ccmpred
conkit.io.clustal
conkit.io.comsat
conkit.io.epcmap
conkit.io.evfold
conkit.io.fasta
conkit.io.freecontact
conkit.io.gremlin
conkit.io.mapalign
conkit.io.mappred
conkit.io.membrain
conkit.io.ncont
conkit.io.pcons
conkit.io.pdb
conkit.io.plmdca
conkit.io.psicov
conkit.io.rosetta
conkit.io.rosetta_npz
conkit.io.stockholm
conkit.io.tests
conkit.io.tests.helpers
conkit.io.tests.test__cache
conkit.io.tests.test__iotools
conkit.io.tests.test__parser
conkit.io.tests.test_a2m
conkit.io.tests.test_a3m
conkit.io.tests.test_aleigen
conkit.io.tests.test_alphafold
conkit.io.tests.test_bbcontacts
conkit.io.tests.test_bclcontact
conkit.io.tests.test_casp
conkit.io.tests.test_caspmode2
conkit.io.tests.test_ccmpred
conkit.io.tests.test_clustal
conkit.io.tests.test_comsat
conkit.io.tests.test_epcmap
conkit.io.tests.test_evfold
conkit.io.tests.test_fasta
conkit.io.tests.test_freecontact
conkit.io.tests.test_gremlin
conkit.io.tests.test_mapalign
conkit.io.tests.test_mappred
conkit.io.tests.test_membrain
conkit.io.tests.test_ncont
conkit.io.tests.test_pcons
conkit.io.tests.test_pdb
conkit.io.tests.test_plmdca
conkit.io.tests.test_psicov
conkit.io.tests.test_rosetta_npz
conkit.io.tests.test_stockholm
conkit.misc
conkit.misc.bandwidth
conkit.misc.distances
conkit.misc.energyfunction
conkit.misc.selectalg
conkit.misc.selector
conkit.plot
conkit.plot.contactdensity
conkit.plot.contactmap
conkit.plot.contactmapchord
conkit.plot.contactmapmatrix
conkit.plot.distogramheatmap
conkit.plot.figure
conkit.plot.modelvalidation
conkit.plot.precisionevaluation
conkit.plot.sequencecoverage
conkit.plot.tools
conkit.version